قال الشيخ على عبد الباقى، الأمين العام لمجمع البحوث الإسلامية، إن هناك بعض السلبيات التى هى الهم الأكبر لشيخ الأزهر، ولذلك كون برلمان الوافدين للتواصل بين الطلاب الوافدين الدارسين بالأزهر، لنقل السلبيات التى تتعرضون لها. واعترف الأمين العام لمجمع البحوث الإسلامية، خلال المؤتمر السنوى الأول للوافدين بالأزهر الشريف، أن هناك بالفعل سلبيات، وإن كانت قليلة. وأضاف "إننا نحاول حلها"، معددا السلبيات التى تحدث من قبل الوافدين للتعلم بالأزهر، الذين يتركونه من أجل التعلم فى جامعات أخرى والالتحاق بمذاهب أخرى، بعيدة عن الوسطية والاعتدال والعودة إلى بلده، لنشر مذاهب متعصبة باسم الأزهر. واستطرد: "هذا ما لا نرضاه، فالطالب الذى يخرج عن خط الأزهر الشريف يجب أن تبلغونا به فنحن خدامكم فى مصر". وعن الدكاترة الذين يحاضرون الطلبة الوافدين باللغة العامية، قال إن شيخ الأزهر وجه بضرورة تدريب هؤلاء الدكاترة على التعليم باللغة الفصحى، ويكون هناك برنامج لإعداد هؤلاء الأساتذة، بحيث يتم التغلب على هذه المشكلة بداية من العام المقبل.