أثارت كلمات الدكتور محمد بديع التي ألقاها في وادي النطرون هذا الأسبوع ردود فعل واسعة عقب التغطية الموسعة التي حظيت بها حيث قال :"تعالوا نعود بثورتنا إلى ربنا الذي نصرنا وبدل حالا من بعد حال" احتفالا بافتتاح دار الإخوان المسلمين بحضور أكثر من 5 ألاف شخص من شباب الجماعة , وقال بديع إن الإخوان ومعظم الشعب المصري عاش عشرات السنين ينتظر يوم حرية مصر وزوال كابوس الظلم والطغيان، حتى أنعم الله علينا بنعمة الحرية، مضيفا: هل نذهب بنتائج الثورة لغير الله بعد كل هذا؟. وأكد أن افتتاح المقر الجديد ليس للإخوان فقط ، بل للشعب المصري بكل طوائفه ، وحث أعضاء الجماعة على السعي في حاجة الجيران والأهل وحسن الخلق قائلا "واعلموا أنكم لن تسعوا الناس بأموالكم ولكن ببسط الوجه وحسن الخلق" حذر بديع من لصوص الثورة ، الذين يحاولون أن يفسدوا فرحة شعب مصر ويعملون علي نشر الفتنة والوقيعة بينهم ، وقال إن لكل نعمة لصوص واستشهد بديع بقول الله عز وجل " يبغونكم الفتنة وفيكم سماعون لهم" ، مؤكدًا على رفضه كل محاولات الوقيعة بين "الجيش والشعب"، و"الجيش والوزارة"، و"المسيحيين والمسلمين" ، مضيفا إن شعب مصر هو حارس الثورة , وأضاف بديع أن « دير وادي النطرون» الذي انقطع رهبانه عن الدنيا لعبادة الله هم أهلنا وجيراننا » ، مشددا على أن الأقباط هم شركاء الوطن ويجب أن يحسن الجميع معاملتهم والتصدي لكل محاولات الوقيعة بين طوائف الشعب المصري الذي عرف علي مر العصور بوحدته وتماسكه . وقال "بديع "عن سجن وادي النطرون :" إذا تذكرنا سجن وادي النطرون الذي قبع الإخوان خلف قضبانه نتذكر نصر الله فإذا ما كان هناك في يوم من الأيام بسجن طره عنبر يسمى عنبر الإخوان فهناك اليوم عنبر يسمي عنبر الحزب الوطني ، فنحن كنا على يقين أن الله ناصرنا ففي الكتاب العزيز ينادي أصحاب الجنة أصحاب النار فالنداء في زمن الماضي وهو في المستقبل فهو واجب التحقيق وسنن النبي الكريم تؤكد اليقين في نصر الله وتمكينه وصدق وعده ".
وعن طعم الحرية التي من الله بها على شعب مصر بكل طوائفه قال :" لم أتخيل أن أزور وادي النطرون ولا أزور سجنها فالبارحة جلست مع نائب رئيس الوزراء ووزير الداخلية ومن قبلها التقيت رئيس السودان بقصر القبة فيستعجب البشير فقلت له إن الله إذا أراد أمرا أنفذه ، وأوضح أن البشير قال له لقد عرضت علي مبارك أن أزرع له القمح علي أرضنا بحصتنا من المياه فرفض بحجة خوفه من أمريكا أن تغضب ، وتحدث عن لقائه برئيس تركيا عبد الله جول الذي قال أنكم تستطيعون صناعة النهضة فأنتم أفضل من تركيا فقد كان الجيش ضدي وتملكون الأخلاق ".