انتقد الدكتور بدر الشافعي خبير الشؤون الأفريقية بجامعة القاهرة, الضجة الإعلامية التي أثيرت بحكومة قنديل حول سد النهضة، والتي كانت تطالبه بالتصعيد ضد الحكومة الإثيوبية, والتعامل الناعم لتلك الأصوات المعارضة بحكومة الانقلاب وترحيبها ببناء السد في الوقت الحالي! وأكد الشافعي، في مداخله هاتفية للجزيرة مباشر مصر، أن الحديث عن مخاطر السد كانت المعارضة تستخدمه كورقة سياسية لافتعال مشاكل وأزمات للرئيس لإثارة حالة من الجدل والتخبط في الشارع المصري والنيل من الحكومة بكثرة إظهار سلبيات ومشاكل لا أساس لها على أرض الواقع. وقال: إن الموقف المصري والسوداني بحكومة قنديل ارتكز على محاولة تجنب أي آثار سلبية لبناء السد, وان الموقف السياسي فقط هو الذي تغير, مشيرا إلى أن مصر لن تتضرر مائيا من انشاء سد النهضة، ولن تؤثر على حصتها المائية وأنه تم لاتفاق بين وزارة خارجية قنديل ووزارة خارجية اثيوبيا حول الفترة التي سيتم فيها ملء هذا الخزان.