بلغت موازنة المجلس في الموازنة العامة لعام 2016 /2017 نحو مليار و285 مليون جنيه بزيادة بلغت 401 مليون و985 ألف جنيها، وبلغت الاعتمادات الخاصة بالأجور 99 مليون جنيها، وطالب المجلس بأن تصل إلى 115 مليون جنيها، مشيرا لوجود عجز قدره 16 مليون جنيها. وأوصت لجنة الشباب، بتقريرها حول موازنة المجلس القومي للشباب إلى لجنة الخطة والموازنة، إضافة إلى زيادة الاعتمادات لباب الأجور لمواجهة الإنفاق على علاج العاملين والمكافآت وكذلك الجهود غير العادية والحوافز والمكافآت الأخرى وحافز الماجستير والدكتوراة، وفي باب شراء السلع والخدمات بلغ الاعتماد على هذا الباب 4 مليون و600 ألف جنيه مقابل 5 مليون و320 ألف جنيه بتخفيض مليون و120 ألف جنيه. وأوصت لجنة الشباب بزيادة الاعتمادات لهذا الباب لكثرة أنشطة المجلس بالمحافظات على مستوى الجمهورية ومواجهة الصرف على استخدمات المباني، من إنارة ومياه وأمن وحراسة ونظافة وتليفون إضافة إلى ارتفاع مبنى المجلس القومي للشباب واتساع وحداته والمباني التابعة له مثل منتديات شباب ومدن شبابية ومراكز التعليم المدني والمخازن والجراجات. وفي الباب الرابع الخاص ب"الدعم والمنح والمزايا الاجتماعية"، بلغ الاعتماد المدرج لهذا الباب في موازنة عام 2015-2016 نحو 470 مليون جنيها. واقترح المجلس القومي للشباب، زيادته إلى 539 مليون و250 ألف جنيه، بينما وافقت وزارة المالية على زيادة اعتماد هذا الباب بمقدار 10 مليون جنيه، لتصل تقديرات هذا الباب في موازنة المجلس للعام المالى 2016 - 2017 إلى 480 مليون جنيها، بعجز قدره 59 مليون و250 ألف جنيه عن مقترح المجلس القومي للشباب. وأوصت اللجنة بزيادة الاعتمادات المدرجة لهذا الباب فى موازنة المجلس القومي للشباب لدعم مراكز التعليم المدني بالمحافظات وكذك منتديات الشباب والمدن الشبابية والصرف على أهداف الاستراتيجية العامة للمبادرات والمشروعات المشتركة، التي تقوم بها وزارة الشباب والرياضة بالتعاون مع الوزارات المختلفة مثل وزارات "التنمية المحلية"، و"التربية والتعليم" و"التعليم العالي" و"الثقافة" وجامعة الأزهر والمعاهد الأزهرية، علاوة على الصرف على الأنشطة المطلوب تنفيذها بتلك المراكز والمدن الشبابية، ومواجهة المصروفات الإعتيادية من استهلاكات المياه والكهرباء ومصروفات الأمن والحراسة والنظافة والزراعة، وزيادة الاعتمادات المالية المخصصة لبند دعم أنشطة مراكز الشباب وبند الاعانات الإنشائية المستخدم فى تطوير المنشآت الاجتماعية، وسداد المطالبات المالية المستحقة للجهات التى تقوم بتنفيذ المشروعات بمراكز الشباب. وأوصت اللجنة، بضرورة وجود بند خاص بدعم وتطوير وصيانة مراكز الشباب لايقل المخصص له عن 30 مليون جنيها، للصرف على عملية التطوير وصيانة الملاعب الرياضية والمنشآت الاجتماعية التى تخدم الشباب وأهالى المنطقة المحيطة. وفي الباب السادس الخاص ب"شراء الأصول غير المالية "الاستثمارات"، بلغ الاعتماد المدرج لهذا الباب فى موازنة عام 2015- 2016 مبلغ 300 مليون جنيها، وكان مقترح المجلس القومي للشباب زيادته إلى 680 مليون جنيها، بينما وافقت وزارة المالية على زيادة اعتماد هذا الباب بمقدار 55 مليون جنيها لتصل تقديرات هذا الباب فى موازنة المجلس للعام المالى 2016-2017 إلى 355 مليون جنيها بعجز قدره 325 مليون جنيها عن مقترح المجلس القومي للشباب. وأوصت اللجنة، بزيادة الاعتمادات المدرجة لهذا الباب في موازنة المجلس القومي للشباب لسداد الالتزامات المالية المستحقة عليه للجهات المنفذة لمشروعات تطوير مراكز الشباب وإنشاء الملاعب الجديدة، ولاسيما الجهات التابعة للقوات المسلحة مثل وزارة الانتاج الحربى وجهاز مشروعات الخدمة الوطنية والهيئة الهندسية للقوات المسلحة. وفي ضوء مناشدة وزارة الشباب والرياضة لوزارة التخطيط، بضرورة تدبير بعض الاعتمادات المالية لسداد بعض من مديونياتها المستحقة لدى الجهات سالفة البيان فقد تم موافاتها بخطة إضافية بمبلغ 50 مليون جنيها، وكذلك مبلغ 100 مليون جنيه خلال خطة 2015 - 2016.