مع تجدد فتح ملف الشيعة في مصر، عمت الفرحة، الأوساط الشيعية، بظهور قارئ القرآن الكريم الطبيب أحمد نعينع، في حفل أداء المشير عبدالفتاح السيسي لليمين الدستورية كرئيس للبلاد، وقراءة نعينع آيات الذكر الحكيم في احتفالية التنصيب في قصر القبة الرئاسي ل «المرة الثانية» في اليوم نفسه، وفي حضور وزير الأوقاف مختار جمعة، رغم أن وزارة الأوقاف أحالت نعينع، ضمن أربعة من قراء القرآن الكريم لسفرهم إلى إيران والعراق من دون تصريح، «ورفع الأذان بالطريقة الشيعية»، إلى التحقيق، وتم إبلاغ الجهات الرسمية المعنية، «حفاظا على الأمن القومي المصري ووحدة النسيج المجتمعي». ظهور نعينع، في الحفل الرسمي للرئيس الجديد، كان سببا في ابتهاج أوساط شيعية اعتبرت أن الحملة التي قادها «ائتلاف الدفاع عن الصحابة وآل البيت السلفي»، لم تستطع منع مؤيدي منهجهم من الظهور في المناسبات الرسمية. واعتبر الطاهر الهاشمي، أحد أبرز الرموز الشيعية في مصر أن «قراءة نعينع، أمام الرئيس السيسي رد بالغ على وزير الأوقاف المصري ونقيب قراء القرآن الكريم الشيخ محمود الطبلاوي». وأوضحت مصادر داخل وزارة الأوقاف أن «الوزير، استشعر الحرج الشديد من وجود نعينع في الحفل، لعدم علمه بحضوره»، وأشارت «إلى قيام لجنة شؤون القرآن الكريم بإعداد مذكرة بالتعاون مع نقابة القراء تمهيدا لرفعها إلى رئاسة الجمهورية، مصحوبة باسطوانة مدمجة عليها التلاوات التي قرأها نعينع أثناء وجوده في إيران وأدائه الأذان بصورة شيعية بما يتناقض مع منهجية الأزهر الشريف، وتحديد عدد مرات سفره لإيران، لتكشف للرئاسة أن علاقة نعينع بإيران تهدد الأمن القومي». ووصف مؤسس «ائتلاف الدفاع عن الصحابة وآل البيت»، القيادي السلفي ناصر رضوان، استضافة المسؤولين عن مراسم احتفال رئاسة مصر، القارئ أحمد نعينع، بأنه «محاولة لغسيل سمعته، كما يغسل تجار المخدرات أموالهم»، مشككا «في نوايا المختصين بدعوته بعد علمهم بقرار إيقافه وإحالته الى التحقيق من جانب وزارة الأوقاف ونقابة القراء»، كاشفا أن «نعينع، حضر من حضن خامنئي في إيران إلى حفل تنصيب الرئيس السيسي مباشرة». يذكر أن نعينع، كان القارئ الرسمي الأول، لمعظم رؤساء الجمهورية السابقين، فقد اختاره الرئيس الراحل أنور السادات ليكون القارئ الرسمي لجميع احتفالاته، وظل في المكانة نفسها في عهد الرئيس السابق حسني مبارك، ثم الرئيس المعزول محمد مرسي، ثم الرئيس الموقت عدلي منصور، ويبدو أنه سيظل القارئ الرسمي في عهد السيسي أيضا بعد ظهوره بحفل أدائه اليمين الدستورية. واشتهر نعينع بعدم ارتدائه عمامة الأزهر، خلافا لمشاهير القراء معللا ذلك بأن مهنته الأصلية كطبيب بشري، فرضت عليه ذلك.