نشر مركز ابن خلدون للدراسات الإنمائية والحقوقية تقريرا رصد فيه أعداد ضحايا اعتداءات جماعة الإخوان المسلمين، وأكد المركز أن عنف جماعة الإخوان المسلمين أدى منذ 30 يونيو وحتى إعلان الجماعة إرهابية إلى سقوط 1740 مصابا و124 قتيلا في 65 إعتداء. وقال التقرير إن أحداث عنف وقعت في بعض محافظات مصر، مشيرا إلى أن أعداد الضحايا والمصابين في أحداث القتل والتعذيب على أيدي أعضاء جماعة الإخوان فيما قبل فض إعتصامي رابعة والنهضة شملت 82 قتيلا أثناء الإشتباكات و3 قتلى عمد و22 حالة تعذيب حتى الموت و44 حالة تعذيب واعتداء. ورصد التقرير أعمال العنف التي اتهم الاخوان بارتكابها في الساعات الأولى لفض الإعتصامين في 14 أغسطس 2013 وحتى ال 7 أيام التي تلت الفض، وأستهدف أعضاء جماعة الإخوان في هذه المرحلة - بحسب المؤسسة - المنشأت العامة والشرطية والكنائس كنوع من أنواع رد الفعل على فض الإعتصامين، وأسفرت تلك الأحداث عن 11 اعتداء على ممتلكات عامة و9 اعتداءات على منشأت شرطية و23 اعتداء على الكنائس والمنشأت التابعة لها و7 حالات ترويع مدنيين وحالتي اعتداء على ممتلكات خاصة. وأشار التقرير إلى أن المرحلة التالية اتسمت بتصاعد المظاهرات والاحتجاجات التي كانت في أغلبها تنتهي باشتباكات، كما تسببت هذه المظاهرات في تعطيل سير الحياة عن طريق محاولات تعطيل الدراسة في الجامعات، وكذلك محاولة شلل القاهرة الكبرى بتعطيل خطوط المترو، مشيرا إلى أن تلك المرحلة خلفت 17حالة وفاة و228 مصابا نتيجة 21 اعتداء.