قد تتسبب حبوب منع الحمل في الإصابة بالصداع النصفي خلال فترة الطمث، والذي يظهر عادةً في الإصابة بآلام في الرأس مصحوبة بالشعور بحساسية تجاه الضوء وشعور بالغثيان. وأوضح أطباء الغدد الصماء أن الصداع النصفي خلال فترة الطمث يرجع إلى التغيّرات الهرمونية التي تطرأ على الجسم في هذه الفترة، إذ عادةً ما تتعاطى المرأة الراغبة في منع الحمل الحبوب طوال 3 أسابيع، بينما تتوقف عنها لمدة أسبوع خلال فترة الطمث. ونظراً لأن هذه الحبوب تتكون في الأساس من هرموني الإستروجين والبروجستين، لذا تنخفض نسبة هرمون الإستروجين لديها بشكل سريع عند التوقف عن تعاطي الحبوب خلال فترة الطمث، ما يؤدي إلى إصابتها بأعراض انسحاب مفاجئة، ومن ثمّ تُصاب بالصداع النصفي.