كشف الشيخ طارق الرفاعي شيخ الطريقة الرفاعية عن أنهم كانوا يؤيدون مرسي طيلة الفترات السابقة مؤكدا على أن الله وفقهم في اختيار "الرجل المناسب في المكان المناسب". وقال الرفاعي، في بيان للطريقة، "الصوفية من الإخوان، ونحن منهم، فحسن البنا كان صوفيا حصافيا، نسبة إلى الطريقة الحصافية، كما أن هناك عددا كبيرا من الصوفية ينتمي لجماعة الإخوان المسلمين". وأكد الرفاعي على أن الإخوان "لن يهدموا أضرحة الصوفية، ولن يقضوا على موالدهم، لأن الإخوان فصيل وطني شريف كبقية الفصائل الوطنية". وتابع "الإخوان ليسوا فزاعة كما يحاول البعض أن يصورهم، لكن ندرك أن الإخوان والسلفية فصيل من أبناء الوطن لابد أن يتحدا مع جميع التيارات من أجل مصر". وهنأ الرفاعي الشعب المصري بفوز مرسي، "مبروك على الشعب المصري نجاح الثورة المصرية"، موجها الشكر لأبناء الطريقة الرفاعية على العموم، وخص بالذكر أبناء الطريقة في الصعيد والإسكندرية والبحيرة، "أقول لأبناء الطريقة الرفاعية أنتم سجلتم أشرف كلمة في التاريخ باختياركم مرسي".