أصدر البابا تواضروس الثانى، بابا الإسكندرية وبطريرك الكرازة المرقصية، قرارا بابوي برقم 29 لعام 2013 بتعيين الدكتور سامي صبري شاكر، عميداً لمعهد الدراسات القبطية، وإسناد مسئولية إدارة كل الأقسام بالمعهد له. كما اصدر قرارا آخر برقم 30 – بتعيين الدكتور عادل فخري صادق، وكيلا لمعهد الدراسات القبطية، ورئيساً لقسم الأثار بها.