أصدر البابا تواضروس الثانى بابا الاسكندريه وبطريرك الكرازه المرقسيه قرار الباباوي رقم 29 لعام 2013 والخاص بتعيين " الدكتور سامي صبري شاكر " عميداً لمعهد الدراسات القبطية ، وإسناد مسئولية إدارة كل الأقسام بالمعهد له. كما اصدر قرارا اخر رقم 30 بتعيين الدكتور عادل فخري صادق وكيلا لمعهد الدراسات القبطية ، ورئيساً لقسم الاثار.