أصدر الدكتور هشام قنديل، رئيس مجلس الوزراء، القرار رقم 11 لسنة 2013 بنقل تبعية مستشفى الجهاز الهضمي والحميات من مديرية الشئون الصحية إلى جامعة بورسعيد على أن يشمل النقل جميع أصول المستشفى والعاملين بنفس درجاتهم المالية لتكون نواة لإنشاء كلية الطب بالجامعة بداية من العام القادم لخدمة أهالي المحافظة والمحافظات المجاورة. وبدأت عمليات التنسيق بين جامعة بورسعيد وجامعة قناة السويس بهدف التعاون مع أعضاء هيئة التدريس بكلية الطب وتنفيذ بروتوكول تشغيل المستشفى من خلال الخبرات البورسعيدية لحين إنشاء كلية الطب بجامعة بورسعيد. وأكد الدكتور عماد عبد الجليل رئيس الجامعة بأن عجلة العمل الفعلي لتجهيز المستشفى ستدور بأسرع وقت لتحقيق هذا الحلم الذي ينتظره أهالي بورسعيد والمحافظات المجاورة لتكون نواة لتقديم منظومة طبية متميزة من خلال إمداد المستشفى بكوادر متميزة، ووجه رئيس الجامعة الدعوة لجميع أهالى بورسعيد سواء من المجتمع المدني أو رجال الأعمال أو الجهات التنفيذية لتقديم كافة الإمكانيات والمساعدات اللازمة لإقامة وافتتاح المستشفى الجامعي بعد تجهيزها بالتجهيزات المناسبة لتقديم خدماتها في أسرع وقت وتوفير المعدات الطبية اللازمة للمستشفى من خلال المشاركة المجتمعية بما يتوازى مع مد المستشفى بالأجهزة التي تحتاجها عن طريق وزارتي الصحة والتعليم العالي من خلال موازنة الدولة.