ذكرت تقارير أعدتها جمعيات حقوقية معنية بأوضاع المعتقلين والأحوال داخل السجون أن مئات الشكاوى وردت لهذه الجمعيات حول تدني الأوضاع بها وانهيار مستوى الرعاية الموجهة للمعتقلين.. يأتي على رأس هذه الأوضاع بالغة السوء انتشار الأمراض المعدية ومن أكثرها انتشارا وخطورة الأمراض الجلدية مثل الجرب.. ويتضافر مع انتشار الأمراض المعدية داخل المعتقلات غياب ملحوظ للرعاية الطبية وإهمال يؤدي في كثير من الحالات لوفاة المعتقل أو السجين المريض.. بعد ذلك تنضم لقائمة الأوضاع الفاسدة داخل السجون الأطعمة الغير صحية والتي تسبب بدورها آلام المعدة والأمعاء والقولون.. ثم يأتي دور غياب التهوية داخل الزنازين ويأتي على رأس السجون الأسوأ أوضاعا في مصر سجن أبو زعبل يليه سجن الوادي الجديد ثم سجن طرة..