أدان حزب مصر الثورة، برئاسة المهندس محمود مهران، وقوع حادث قطار البدرشين، محملاً المسئولية للرئيس محمد مرسي والحكومة عن الحادث، واتهمه بالإهمال في التعامل مع الأزمات وفى إدارة البلاد، وعدم اتخاذ وسائل وتدابير لحماية المواطنين من الحوادث المتكررة. وقال مهران، في بيان للحزب، إن ما يحدث من سقوط لقتلى على فترات ليست ببعيدة بسبب الإهمال وسوء الإدارة وعدم تولي من يصلح. ونعى رئيس حزب مصر الثورة أهالي الضحايا وذويهم في فقدانهم لأبنائهم في تلك الحادثة المشينة بهذا الشكل المروع والمتكرر. بينما وجه رسالة إلى الدكتور محمد مرسي قال فيها: "اتركنا وشأننا واترك غيرك يتولى زمام أمورنا وكفى صبرنا على الاقتتال والتناحر فيما بيننا و"عدم رضي الله" عما يحدث في مصر الآمنة، مطالبًا إياه بالرحيل ومن ولاهم المسئولية لأنهم ليسوا أهلاً للمسئولية، على حد وصفه.