نشبت أزمة داخل مجلس النواب، بعد إعلان رئيس البرلمان، د.علي عبدالعال، عدم مناقشة الأوضاع التي حدثت في سيناء، وأنه سيكتفي بمناقشة ما ورد بجدول أعمال الجلسة الطارئة من تعديل قانون هيئة المحطات النووية لتوليد الكهرباء. وأثار الأمر غضب النواب الذين رفضوا ما قاله رئيس المجلس، بينما أصروا على موقفهم، وشدد رئيس المجلس على أن مناقشة أي أمر بخلاف ما ورد بجدول أعمال الجلسة الطارئة يعد مخالفا للائحة. وقال رئيس المجلس: هذا الحدث مؤلم وبشع وموجع، والمجلس أصدر بيانا يعبر عن ألم وحزن جميع الأعضاء وتضامنهم مع الأجهزة الأمنية، موضحا أن المجلس يقوم بمهمة التشريع والرقابة. وأضاف: "الحادث تسبب في وجع للمصريين والعالم، ووحد المصريين جميعا وانتهت المواقف الضبابية وأصبح الجميع على قلب رجل واحد".