استمعت نيابة بني سويف برئاسة رئيس النيابة الكلية المستشارمحمد شلقامي، وإشراف المحامي العام لنيابات بني سويف المستشار تامر الخطيب إلى أقوال سائق القطار رقم 993 مميز المتسبب في الحادث. وقد اتهم خلال تحقيقات النيابة، عاملي «البلوك» و«المزلقان» بأنهما المتسببان في حادث القطارواصطدام القطار بالصدادة الحديدية الموجودة في نهاية خط التخزين. وأَضاف السائق خلال التحقيقات أنه «لم يشاهد العلامات الصفراء ولا الحمراء وأن جهاز ال ITC سيكشف حقيقة أنه لم يتلق الإشارات المعمول بها في السكة الحديد». فيما أكد كلا من أحمد محمد ناصف عبدالحفيظ« 30 سنة- عامل البلوك»، وعبدالرحمن ربيع ممدوح« 25 سنة- عامل المزلقان». وقال العاملان أن سائق القطار تلقى الإشارات الصفراء والحمراء، وتم تحويله إلى حوش التخزين وبعد التحويلة كان يجب عليه تهدئة سرعة القطار إلى 8 كيلو مترات، خاصة أن المسافة بين الصدادة الحديدية والقطار ما يقرب من 660 مترًا، واحتكم العاملان إلى صندوق الITC الموجود في الجرار. وقد أمرت النيابة بتشكيل لجنة فنية من هيئة السكة الحديد لمعرفة أسباب الحادث وتحديد سرعة السائق وقت الحادث وحصر التلفيات التي وقعت جراء الحادث. كان قد وقع الحادث فجر الخميس 11 فبراير، بمزلقان الشناوية محطة قطار مركز ناصر بني سويف.