قرر المجلس القومي لحقوق الانسان في أول اجتماع له بتشكيله الجديد تشكيل لجان تقصي حقائق للأحداث التي شهدتها البلاد منذ 30يونيو 2013 وحتي الآن وخاصة فض اعتصامي رابعة والنهضة ، ووفاة المقبوض عليهم في سيارة الترحيلات أمام سجن أبوزعبل ، وقتل افراد الشرطة في قسم كرداسة ، وحرق وتدمير الكنائس، علي ان تضم كل لجنه عدداً من أعضاء المجلس يعاونهم باحثون ومحامون من العاملين بالمجلس . كما قرر المجلس إنشاء خط ساخن لتلقي بلاغات المواطنين عن عمليات القبض والحبس الاحتياطي للتأكد من أنها تتم في إطار القانون واحترام حقوق الإنسان. ووضع برنامج لزيارة السجون وأماكن الحجز في أقسام الشرطة لمتابعة أحوال المحبوسين إحتياطياً والمسجونين عموماً . ويصدر تقرير شامل عن حالة حقوق الإنسان من واقع أعمال هذه اللجان ومتابعة وتوثيق المجلس للأحداث الآخري والخط الساخن عن الفترة من 30يونيو وحتي 30 سبتمبر 2013 وتتضمن توصيات محددة حول ما انتهت إليه أعمال اللجان. وتقرر تكريم الدكتور بطرس بطرس غالي بإختياره رئيساً شرفياً للمجلس مدي الحياة تقديراً لدوره في تعزيز حركة حقوق الإنسان في مصر اثناء رئاستة للمجلس منذ إنشائه عام 2004.وطلب المجلس الاسراع بإصدار التعديلات المقترحة في قانون إنشاء المجلس لتعزيز استقلاليته والتواصل مع الدكتور رئيس مجلس الوزارء لإصدار هذه التعديلات وإعداد تعديلات في بعض التشريعات المتصلة بحقوق الإنسان وخاصة ما يتصل بموضوع التعذيب . والتوصية لدي مجلس الوزراء بالموافقة علي إنشاء المكتب الاقليمي لمفوضية حقوق الإنسان بالقاهرة تعزيزاً لمكانة مصر والمجلس القومي لحقوق الإنسان لدي الحركة العالمية لحقوق الإنسان.