علي امتداد نهر النيل بمحافظة سوهاج من مركز البلينا جنوبا وحتي مركز طما شمالا المحافظة بطول حوالي 125 كم، تعرض حرم النهر الخالد خلال سنوات طويلة سابقة الي التعديات سواء بالمباني او بالقاء الصرف المنزلي والزراعي والردم ومخلفات الانشطة الصناعية داخل المجري المائي قيام مصنع سكر جرجا بتصريف دورة التبريد في النهر بدعوي انها مياه نظيفه رغم انه تم تحرير عدة محاضر ضد المصنع منها المحضر 32 لسنة 2012 والمحضر 45 في نوفمبرمن نفس العام وذلك لمخالفته للقانون 48 لسنة 1984. وقام جهاز شئون البيئه بأخذ عينة من مياه الصرف النهائي للمصنع في مايو من نفس العام وجاءت النتيجه سلبيه وغير مطابقة للمعايير القياسيه وذلك لارتفاع تركيز الاكسجين المستهلك كيميائيا وارتفاع نسبة المواد الصلبة عن الحد المسموح به و تم اخطار رئيس قطاع المصنع بتاريخ 24/7/ 2012 بسرعة تصحصح وتوفيق اوضاعه، و بالرغم من ذلك ما زال الصرف مستمر الامر الذي يمثل خطورة علي الصحة العامة للمواطنيين. ويطالب اشرف محمد علي مهندس زراعي من مدينة جرجا أجهزة وزارة الصحة بضرورة اجراء التحاليل الدورية لعينات المخلفات السائلة المعالجة من المنشآت التي تم الترخيص لها بالصرف في مجاري المياه حفاظا علي الصحة العامة. ويضيف ناجح عبد الرحيم موظف من اخميم: هناك عمليات ردم لمساحات كبيره في حرم النهر والبناء عليها شهدتها السنوات الماضية وخاصة بعد ثورة 25 يناير وعلي سبيل المثال ما يحدث في قرية "الكولا" بمركز اخميم من مباني خرسانية تمت ازالتها سريعا وايضا في قرية "قلفاو" التابعة لمركز سوهاج حيث تم ردم مساحات من طرح النهر تمهيدا للبناء عليها . كما تضمنت المخالفات قيام المزارعين بالقاء المواشي النافقة علي جانبي النهر وفي عمقه احيانا وهذا يحتاج لتفعيل القانون بشكل فوري لردع المخالفين. ويقول الدكتور عبد العليم ابو العمايم من مركز جرجا: تم التعدي بالردم علي طرح النهرعلي مساحات تصل الي 500 فداناً و تم بناء منازل عليها وتوصيل المرافق لها بكل سهولة! ويؤكد مصطفي جابر من مركز البلينا وجود تعديات علي النهر تتمثل في بناء بعض الاهالي منازلهم في حرم النيل وعلي بعد مسافة امتار قليلة من المياه ،فكيف يتم السكوت علي هذه التجاوزات وكيف تم السماح بإقامة هذه المنازل والفنادق والابراج المخالفة سواء في عاصمة المحافظه او مراكزها وتوصيل المرافق اليها. من جانبة، يوضح المهندس رفعت نجيب مدير ادارة حماية النيل بسوهاج ان 90 % من هذه المخالفات والتعديات تمت ازالتها تمكنت الإدارة خلال الفترة القريبة الماضية وبالتنسيق مع المحافظة والاجهزة الامنية من ازالة 800 مخالفة من اجمالي 1300 مخالفة علي ارض طرح النهر وسيتم قريبا الانتهاء من إزالة المخالفات المتبقية، وعددها 500 حالة مع بحث حالة المباني القديمة تمهيدا لازالتها حفاظا علي اراضي طرح النهر والمجري المائي، وتطبيق قانون البيئة علي المخالفين وتكثيف المرور علي المنشات وكذلك مصنع سكر جرجا للتأكد من مدي مطابقة المخلفات للمواصفات ولمنع حدوث اي تلوث كما يجري حاليا أعمال الصيانه الدورية لمجري النهر من الحشائش بتكلفة 2 مليون جنيه وتنفيذ اعمال التكاسي بالدبش امام القري والمناطق الواقعة عليه لمنع اي تعديات جديده بتكلفة 21 مليون جنيه بتمويل من الصندوق الاجتماعي للتنمية ووزارة الري.