في إطار محاربة الفساد بوزارة الأوقاف وبعد اكتشاف الكثير من السلبيات داخل المساجد نتيجة الخلاف بين إمام المسجد ومجلس الإدارة. وتحديدا في المساجد الكبري التي تدر الملايين سنويا من خلال صناديق النذور ودور المناسبات وغير ذلك من الأنشطة, أعلنت وزارة الأوقاف عن تغيير لائحة اختيار مجالس إدارات المساجد, والتي كانت تتم في الماضي من خلال إتفاق رواد المسجد علي بعض الأسماء وإرسالها لوزارة الأوقاف لاعتمادها, وكانت أجهزة الأمن تتدخل في اختيار أعضاء مجلس إدارة هذه المساجد وبعضهم وزراء ومسئولين سابقين. وأكد الدكتور سلامة عبد القوي المتحدث باسم وزارة الأوقاف أن لائحة مجالس إدارة المساجد القديمة كانت سببا في الكثير من المشاكل التي تعوق العمل الدعوي داخل المسجد, وبالتالي تم تغيير هذه اللائحة, وسيصبح اختيار مجلس إدارة المسجد بالانتخاب المباشر من رواد المسجد, وتبدأ هذه العملية من خلال إعلان إمام المسجد عن فتح باب التسجيل في كشف الجمعية العمومية للمسجد, ويتم تحديد موعد لانتخاب مجلس الإدارة المكون من8 أشخاص ويشرف علي عملية الانتخاب كل من إمام المسجد وأكبر أعضاء الجمعية العمومية سنا ومدير إدارة الأوقاف التابع لها المسجد, وبعد إعلان النتيجة يتم رفعها إلي الوزارة لاعتماد مجلس الإدارة لمدة ثلاث سنوات. وأضاف أن الوزارة رفضت فكرة تعيين مجالس إدارات المساجد بهدف ترك هذه المهمة لرواد المساجد ومنعا لأي شبهات تتردد حول الشخصيات الذين يتم تعيينهم بالمساجد, وأيضا لإتاحة الفرصة لأهالي المنطقة التي يوجد بها المسجد لإنتخاب الشخصيات القادرة علي تنظيم العمل بالمساجد ورعايتها, مشيرا إلي أن إمام المسجد سيكون مشرفا علي مجلس الإدارة ولن يكون عضوا بالمجلس وذلك تقديرا للرسالة التي يؤديها.