حدد المجلس الأعلى مراحل التقديم بالنظام الجديد الخاص بالتنسيق... وتشمل المرحلة الأولى الحد الأدنى للتقدم (وليس القبول) لكليات الجامعات الخاصة بناء على قرار مجلس الجامعات الخاصة والأهلية أو بتكليف لهيئة المكتب وفقًا للمجموع الكلي لدرجات الطلاب المصريين. ويتم إعلان الحد الأدنى للمرحلة الأولى خلال يومين من إعلان نتيجة الثانوية العامة، ويكون تقدم الطلاب الوافدين وفقًا للحد الأدنى المقرر لهم ويتقدم الطلاب بأوراقهم للجامعات في موعد أقصاه عشرة أيام منذ إعلان نتيجة الثانوية العامة، وتتقدم الجامعات بأصول شهادات الطلاب المقبولين نهائيًا لمكتب القبول فور انتهاء المرحلة لمراجعتها. أما بالنسبة للمرحلة الثانية تحدد هيئة المكتب الحد الأدنى للتقدم (وليس القبول)، لكليات الجامعات الخاصة، وذلك في ضوء نتائج تنسيق المرحلة الأولى والأعداد المتبقية بكليات الجامعات الخاصة، بعد الانتهاء من إعداد بيان بأعداد الطلاب والحد الأدنى للقبول بكل كلية، وذلك بعد يومين من إغلاق باب القبول بالمرحلة الأولى. ويتقدم الطلاب بأوراقهم للجامعات في موعد أقصاه خمسة عشر يومًا من إعلان الحد الأدنى للتقدم للمرحلة الثانية، وتتبع نفس خطوات المرحلة الأولى من القبول بالجامعات الخاصة في ضوء ما تبقى من الأعداد المقررة، ونسب توزيع هذه الأعداد على المرحلة الثانية. وتكلف المرحلة الثالثة هيئة المكتب بتحديد الحد الأدنى للتقدم (وليس القبول) لكليات الجامعات الخاصة، وذلك في ضوء نتائج تنسيق المرحلة الثانية والأعداد المتبقية بكليات الجامعات الخاصة، وتخصص في الغالب لطلاب الشهادات الأجنبية، وذلك بعد يومين من إعداد بيان بأعداد الطلاب والحد الأدنى للطلاب المقبولين بالمرحلة الثانية. وألزم المجلس كل جامعة بتسليم الطلاب المتقدمين إيصال بقيمة 300 جنيه قيمة مظروف التقدم للجامعة والاختبارات التي تؤديها، وينتهى مكتب القبول بأمانة المجلس من أعماله في موعد غايته الخميس الأخير من شهر سبتمبر من العام الجامعى. أما عن نظام القبول بالفصل الثانى فيتم فتح باب تقدم الطلاب للكليات التي بها أماكن شاغرة من الأعداد المقررة لكل كلية، ويتقدم الطلاب بأوراقهم للجامعات في موعد غايته نهاية شهر يناير من العام الجامعى، وذلك طبقا للحد الأدنى للمرحلة الثالثة من الفصل الدراسى الأول. من جانبه، قال جمال نوارة- أمين مجلس الجامعات الخاصة والأهلية، إن من أهم مزايا هذا النظام أنه يؤدى إلى ارتفاع الحد الأدنى للقبول بالكليات، كما أنه يفوض هيئة المكتب في إعلان نتيجة المرحلتين الأولى والثانية بعد الانتهاء منها بيومين على أن تبلغ الجامعات فور الانتهاء هيئة المكتب بالحد الأدنى للقبول والأماكن التي شغلت والأماكن المتبقية.