وبَّخ المستشار محمد شيرين فهمي، رئيس هيئة محكمة جنايات القاهرة، التي تنظر محاكمة 68 متهمًا بالقضية المعروفة إعلاميًا ب"خلية الظواهري"، المحامي علي إسماعيل، عضو فريق الدفاع عن المتهمين. ويرجع ذلك إلى مطالبة "إسماعيل" بإرجاء الانخراط في سماع مرافعات الدفاع إلى حين تنفيذ طلبات الدفاع، والتي تتعلق بتفريغ محتوى الفلاشة والاسطوانة المدمجة المتعلقة بالمتهم محمد ربيع الظواهري، وهو ما عقَّب عليه عضو الدفاع قائلاً: "نطالب بتنفيذ ذلك المطلب، وليس هناك "خلاف" بيننا وبين هيئة المحكمة الموقرة"، وهو اللفظ الذي أثار استياء رئيس المحكمة الذي وبَّخ عضو الدفاع قائلاً: إنه لا يصح القول أن يكون هناك خلاف بين المحكمة والدفاع، ليعتذر عضو الدفاع عن ذلك اللفظ قائلاً إنه قد خانه التعبير، ليطلب القاضي بإثبات تلك الواقعة بمحضر الجلسة، وأن ما بدر من عضو الدفاع جاء نظرًا لكونه خانه التعبير. وكشفت تحقيقات النيابة العامة، أن المتهمين من «العناصر الإرهابية» شديدة الخطورة، وقاموا بإنشاء وإدارة تنظيم إرهابي يهدف إلى تكفير سلطات الدولة ومواجهتها باستخدام السلاح، لتغيير نظام الحكم بالقوة، والاعتداء على ضباط وأفراد ومنشآت القوات المسلحة والشرطة، واستهداف الأقباط ودُور عبادتهم واستحلال أموالهم، وارتكاب أعمال إرهابية؛ بهدف نشر الفوضى في البلاد وتعريض أمن المجتمع للخطر.