في إطار استراتيجية وزارة الطيران المدني بقيادة الفريق أحمد شفيق لربط القارة الأفريقية مع بقية العالم من خلال مطار القاهرة المحوري، سوف تسير مصر للطيران رحلتين أسبوعياً إلي مدينة جوبا بجنوب السودان ابتداء من 6 أغسطس 2010 وستنطلق الرحلات يومي الأربعاء والجمعة من كل اسبوع بطراز737 ذات الدرجتين السياحية ودرجة رجال الأعمال. وصرح الطيار علاء عاشور، رئيس مجلس إدارة شركة مصر للطيران للخطوط الجوية: «لدينا خطة طموحة لتوسيع وتطوير الشبكة وسنستمر في تقديم وجهات جديدة في افريقيا وزيادة عدد الرحلات، وذلك بعد التشغيل من مبني الركاب الجديد رقم 3 وكونه مطاراً محورياً وبوابة عبور متطورة للقارة الإفريقية». وأضاف : بالتشغيل إلي جوبا سيكون لدينا 26رحلة أسبوعيا إلي السودان، حيث تطير مصر للطيران من ثلاث إلي أربع مرات يومياً إلي الخرطوم». وأشار المهندس حسين مسعود، رئيس مجلس إدارة الشركة القابضة لمصر للطيران إلي أن توسيع الشبكة في أفريقيا يأتي في إطار الاستراتيجية العامة للشركة القابضة.