أسفرت قرعة التصفيات المؤهلة لكأس الأمم الأفريقية 2017 بالجابون عن وقوع منتخب مصر في المجموعة السابعة مع منتخبات تشادوتنزانيا ونيجيريا. وجاءت نتيجة قرعة المجموعات ال13 على النحو التالي .. المجموعة (1) جيبوتي - ليبيريا - توجو - تونس. المجموعة (2) مدغشقر - أنجولا - الكونغو الديمقراطية - أفريقيا الوسطى. المجموعة (3) جنوب السودان - بنين - غينيا الإستوائية - مالي المجموعة (4) بوتسوانا - أوغندا - جزر القمر - بوركينا فاسو المجموعة (5) زامبيا - غينيا بيساو - كينيا - الكونغو "برازفيل" المجموعة (6) ساو تومي - ليبيا - المغرب - الرأس الأخضر. المجموعة (7) تشاد - تنزانيا - مصر - نيجيريا. المجموعة (8) موريشيوس - رواندا - موزمبيق - غانا. المجموعة (9) الجابون - السودان - سيراليون - كوت ديفوار. المجموعة (10) الجزائر - إثيوبيا - ليسوتو - سيشيل. المجموعة (11) بوروندي - ناميبيا - النيجر - السنغال. المجموعة (12) سوازيلاند - زيمبابوي - مالاوي - غينيا. المجموعة (13) موريتانيا - جامبيا - جنوب أفريقيا - الكاميرون.
يُذكر أن المتصدر يتأهل مباشرة للنهائيات، وأفضل اثنين ثواني، باستثناء المجموعة التاسعة، حيث يتأهل المتصدر فقط لأنها تضم الجابون "منظم" البطولة.