أنتقد الكاتب إبراهيم عيسى، جماعة الإخوان المسلمين، وأتهمهم بخيانة الثورة فهم أول من وضعوا يدهم في يد الراحل عمر سليمان- نائب رئيس الجمهورية السابق، وأول من تحالفوا مع المجلس العسكري وهم من أعلنوها صريحة أن الشرعية للبرلمان وليس للميدان و بعد توليهم الرئاسة وضعوا يدهم في يد الأمريكان.
و قال عيسى: في برنامجه "هنا القاهرة" الذى يُعرض على قناة "القاهرة والناس" أن محاولات الإخوان الحالية ضد القضاء ليست بهدف تطهيره، ولكن بهدف إقصاء القضاء وأخونته ، وهدم جميع منظمات الدولة لبنيها من جديد على أساس إخواني. وصَرّح عيسى، بأن الإخوان يستعينون بعناصر من حماس حاليا مثل الشاب الذى شارك في الاعتداء على الزند ، ومثل العناصر التي اقتحمت الأقسام في أوائل ثورة 25 يناير.
وأضاف عيسى، ساخراً أن النظام السابق كان أرحم من الإخوان، فالنظام السابق لم يستخدم كثير من أساليب البلطجة التي يستخدموها الإخوان، ولم يعتدوا على المتظاهرين بميليشيات مسلحة.