أعلنت لجنة مسابقات دورة حوض النيل عن تقسيم المنتخبات السبع المشاركة في البطولة إلي مجموعتين وتضم المجموعة الأولي أربعة منتخبات، فيما تضم المجموعة الثانية ثلاثة منتخبات فقط. وتضم المجموعة الأولي منتخبات مصر وتنزانيا وأوغندا وبوروندي، فيما تضم المجموعة الثانية منتخبات السودان وكينيا والكونغو الديمقراطيه. وذكر الموقع الرسمي لإتحاد الكرة أنه تم وضع منتخبي السودان وأوغندا في مجموعتين مختلفتين بناء علي طلب الجانب السوداني لوقوع المنتخبين معا في مجموعة واحدة في بطولة كأس أمم إفريقيا للمحليين 2011. وتلعب مصر أولي مبارياتها مع تنزانيا يوم 5 يناير، ثم تواجه أوغندا يوم 8 يناير، فيما تختتم مبارياتها في المجموعة مع بوروندي يوم 11 يناير. ويتأهل الأول والثاني من كل مجموعة إلي الدور قبل النهائي بحيث يلتقي متصدر المجموعة الأولي مع ثاني الثانية، فيما يلعب متصدر المجموعة الثانية مع ثاني المجموعة الأولي. كما سيلتقي الفريقان صاحبي المركز الثالث في كل مجموعة معا لتحديد المركزين الخامس والسادس. وتقام مباراتي الدور قبل النهائي يوم 14 يناير، فيما تقام المباراة النهائية للبطولة يوم 17 من نفس الشهر.