بزعم أنه يهاجم الإخوان المسلمين في خطبه ، حرر الشيخ محمد على جمعة أمام مسجد عباد الرحمن بقرية الجعافرة التابعة لمركز اطسا محضرا بمركز شرطة اطسا رقم 26 أحوال لسنة 2012 يتهم فيه مدير إدارة أوقاف أطسا ومفتش الأوقاف بالإدارة أنهم استولوا على دفتر الحضور الانصراف الخاص بالمسجد والذ ى يقوم بالتوقيع فيه بهدف منعه من التوقيع لإثبات انقطاعه عن العمل بالرغم من تواجدة يوميا داخل المسجد وأنهم أرسلوا إليه إنذارا بالفصل .