ارتفعت تركيزات الاملاح العالية في الخزان الجوفي لمنطقة وادي النيل ب6 مناطق رصدها تقرير حالة البيئة السنوي الصادر عن وزارة البيئة، وهي أطفيح والقبابات وغرب الفشن وغرب طهطا وغرب الأقصر وإسنا مؤكداً عدم صلاحية تلك المياه لاغراض الزراعة. وجاءت تركيزات الملوحة في آبار الرصد الجوفية بمنطقة الصحراء الغربية جيدة ولم تتجاوز الحد المسموح به قانوناً بينما تجاوز تركيز كل من الكلوريد والكبريت في 21% و14% من الآبار علي التوالي بمنطقة سيوة كما تم رصد تركيزات عالية للحديد في حوالي 25% من آبار المراقبة وتم رصد المنجنيز في 2.3% من آبار المراقبة تخطت معه الحدود المسموح بها لأغراض الشرب في المياه الجوفية بالصحراء الغربية. ورصد التقرير تركيزات الحديد بالقاهرة والدلتا بنسب عالية بحوالي 55% في مياه الآبار الجوفية، وجاءت نسب تركيزات الاملاح جيدة حيث تشير النتائج إلي جودة نوعية مياه معظم العينات المأخوذة والتي يمكن استخدامها في أغراض الشرب والزراعة باستثناء مناطق شمال الدلتا والتي تحتاج إلي معالجة تركيزات الأملاح بتلك الآبار حيث اشارت النتائج إلي وجود تركيزات عالية من أملاح كلوريد الصوديوم بعدة نقاط مراقبة بشمال الدلتا نتيجة لتداخل مياه البحر مع المياه الجوفية. وجاءت نتائج رصد ترع مصر العليا لتوافق جميع قيم البكيتريا القولونية مع حدود القانون، وكذلك الاكسجين الذائب Do الذي لم يتعد الحدود المسموح بها إلا في ترعة الكرابية في فصل الصيف. ولم تسجل مراكز الرصد أي زيادة للمواد العضوية من الاكسجين الحيوي الممتص Bod بجميع ترع الوجه القبلي عن الحد المسموح به طوال الشتاء والصيف إلا في نقطة ساقولا.