جاء التصنيف الذي أعلنه "كاف" للمنتخبات المشاركة في التصفيات على أربعة مراحل، ووقع المنتخب المصري البطل التاريخي للقارة في التصنيف الثاني نظراً لغيابه عن البطولات الثلاثة الأخيرة، وأعلن عيسى حياتو رئيس الاتحاد الأفريقي لكرة القدم عن فوز دولة الجابون باستضافة بطولة كأس الأمم الأفريقية 2017 بعد منافسة مع الجزائر وغانا. وجاءت مجموعات تصفيات كأس الأمم كالتالي: المجموعة الأولى: جيبوتي، ليبيريا، توجو المجموعة الثانية: مدغشقر، أفريقيا الوسطى، أنجولا المجموعة الثالثة: جنوب السودان، بنين، غينيا الاستوائية المجموعة الرابعة: جزر القمر، بوتسوانا، أوغندا المجموعة الخامسة: غينيا بيساو، كينيا، الكونغو برازافيل المجموعة السادسة: ساو تومي، ليبيا، المغرب المجموعة السابعة: تشاد، تنزانيا، ، مصر المجموعة الثامنة: رواندا، موريشيوس