محمد بديع أكد الدفاع أمام محكمة جنايات شبرا الخيمة، المنعقدة بمعهد أمناء الشرطة برئاسة المستشار حسن فريد، فى قضية اتهام 48 شخصا بينهم 12 من قيادات جماعة الإخوان، بقطع طريق قليوب أن الدكتور محمد بديع يعد من أهم 100 عالم على مستوى العالم فى تخصصه ، وأن الدكتور محمد البلتاجى يسمى داخل جماعة الاخوان بإسم " محمد مرمره" وذلك لأنه كان فى سلاح المظلات خلال حرب اكتوبر وواجه رصاص المظلات الاسرائيلية بصدره، على حد قوله. ويحاكم فى تلك القضية عدد من القيادات من بينهم محمد بديع المرشد العام للجماعة وعصام العريان ومحمد البلتاجى وصفوت حجازى ومحسن راضى وباسم عودة وأسامة ياسين وعبد الرحمن البر وعبد الله بركات، بالإضافة إلى آخرين من القيادات فى قضية أحداث قطع الطريق الزراعى بقليوب.