رفضت وزارة النقل ما رددته وسائل الإعلام في الآونة الأخيرة عن تكهنات الخبراء باحتمالية دمج وزارة النقل مع وزارات أخرى. أكد الدكتور رجب موسى مساعد وزير النقل، على ضرورة توضيح القطاعات المختلفة بوزارة النقل، وذلك من واقع عمله داخل هذه الوزارة، مشيرا إلى أن وزارة النقل تشمل عدد 10 هيئات كبرى هي هيئة سكك حديد مصر والهيئة القومية للأنفاق والهيئة العامة للطرق والكباري وهيئة تخطيط مشروعات النقل وهيئة ميناء الإسكندرية وهيئة موانئ بورسعيد ودمياط والبحر الأحمر والنقل النهري وهيئة الموانئ البرية والجافة. وأضاف "موسى"، أن هناك جهاز النقل الحضري في القاهرة الكبرى وجهاز النقل البرى بين المحافظات، وكذلك المعهد القومي للنقل ومعهد وردان التابع للسكة الحديد بالإضافة إلى عدد 19 شركة مقسمة على النحو التالي: 9 شركات تابعة لهيئة سكك حديد مصر منها شركة تشغيل المترو وشركات لصيانة السكة والجرارات والنظافة وخدمة عربات النوم والمركز الطبي وشركة المشروعات وغيرها، و4 شركات بقطاع النقل البحري وتشمل شركة القاهرة للعبارات وشركة المساعدات الملاحية وشركة الجسر العربي وشركة ثامكو للنقل البحري، وتشمل الشركة القابضة لإنشاء مشروعات الطرق ولها 4 شركات تابعة هي شركة النيل العامة لإنشاء الطرق و شركة النيل العامة للطرق والكباري و شركة النيل العامة للطرق الصحراوية و شركة النيل العامة للإنشاء والرصف، فضلاً عن ما يزيد عن 9 ورش كبيرة ومراكز للفرز بالسكة الحديد. ونظرًا لكثرة عدد الهيئات والشركات وأهميتها، فإنها تحتاج بدون شك إلى كل الجهود وكامل الوقت من الوزير المسئول عنها، وأنه من غير الملائم التفكير في مثل هذا الدمج لما سيكون له الضرر الكبير على ما تتطلع به قطاعات وزارة النقل من خدمات حيوية وآمال للمواطنين.