نشرت الصفحة الرسمية لحزب الحرية والعدالة، الذراع السياسية لجماعة الإخوان المسلمين، على موقع التواصل الاجتماعي "فيس بوك"، بيانا صدر عن الجماعة حول حادث قطار البدرشين. وقدمت الجماعة في بداية البيان العزاء لأهالي الشهداء في حادث القطار، كما تقدمت بالتعازي للشعب المصري كله. وأردف البيان: "مع تكرار هذه الحوادث واستمرار مسلسل إراقة دماء المصريين على قضبان السكك الحديدية، نناشد جميع أجهزة الدولة أن تتعاون فيما بينها لإجراء تحقيقات موسَّعة لمعرفة سبب الحادث ومن المسؤول عنه ومحاسبته". كما ناشدت جماعة الإخوان المسلمين في بيانها المسؤولين وضع تصوُّر واضح ومدروس للعمل على منع هذه الحوادث في المستقبل؛ من خلال تقديم دراسة شاملة وخطة واضحة تُعرض على الشعب من خلال مؤسساته، وتُوضِّح الإجراءات التي ستُتَّخذ لرفع كفاءة السلامة والأمان بهذا القطاع الحيوي، بداية من العنصر البشري العامل بها إلى وسائل الأمان بهذا القطاع. واختُتِم البيان بالدعاء إلى الله "أن يتقبل شهداءنا بواسع رحمته وفي فسيح جناته، ويلهم أهلهم الصبر والسلوان، ويعجِّل بشفاء الجرحى، ويَمُنَّ عليهم بتمام العافية، وأن يحفظ بلادنا وشعبنا من كل سوء ومكروه".