أكد الدكتور سيف الدين عبدالفتاح، أستاذ العلوم السياسية بكلية الاقتصاد والعلوم السياسية بجامعة القاهرة ومستشار الرئيس السابق، أنه ليس عضوًا بجبهة الضمير الوطني, مشيرا الى احترامه الكامل لما يمثلها من قامات. وأضاف عبد الفتاح عبر صفحته الرسمية بموقع التواصل الاجتماعى "فيس بوك" بأنه أكد مرارًا وتكرارًا دعمه لوثيقة الأزهر وجهد الشباب القائم عليها. كان حزب الحرية والعدالة، الذراع السياسية لجماعة الإخوان المسلمين، قد نشر اسماء 30 من المشاركين في "جبهة الضمير الوطني" تضمنت عددًا من الشخصيات السياسية، كان من بينها اسم الدكتور سيف الدين عبدالفتاح بالاضافة الى عدد من الشخصيات العامة الاخرى.