تحدث الدكتور بديع أثناء نظر أولى جلسات محاكمة عدد من قيادات الإخوان بمعهد أمناء الشرطة من بينهم محمد بديع مرشد الإخوان، والقياديون بالجماعة منهم محمد البلتاجى وعصام العريان في أحداث اشتباكات الجيزة، للقاضي دون إذن، ما دعا القاضي لتوجيه سؤال له: مين سيادتك؟. فرد بديع بقوة قائلا: أنا الدكتور محمد بديع المرشد العام لجماعة الإخوان المسلمين، وهذه الجلسة مسجلة عليك في الملأ الأعلى، وهذا المجلس الذي استولى على السلطة أنت رأيت بنفسك كيف قتل الشعب المصري وجرفت جثثهم وكأنهم قمامة، فأين تحقيقات النيابة في هذه الجرائم، فأنتم شركاء فيها وستحاكمون.
واستكمل قائلا: أنا متهم في 24 قضية وعند بداية التحقيق معى قلت إننى مجنى على ولكن لم يستمع إلى أحد، فنحن نعيش في زمن الإرهاب والتخوين بعد أن سحروا أعين الناس ووسائل إعلام مأجورة تهيجهم ضد الإخوان المسلمين، رغم أننا عشنا معهم عشرات السنوات ولم نقترف أي جريمة بل على العكس سرقت مقراتنا وقتل ابني وحرق بيتي وسرقت أموالي، وعندما أبلغت النيابة العامة لم تفعل أي شيء.
وأنهى حديثه قائلا: "هذه الإجراءات باطلة، والله أصدر أمره من فوق 7 سماوات ونحن متعلقون بالله، فعسى الله أن يأتى بالفتح وأمر من عنده".
وقال: "هذا القائد الذي قتل وذبح شعبه مكانه قفص الاتهام، ويشهد الله أن الإخوان المسلمين ما قتلوا شعبهم وما اقترفوا عنفا"، فقاطعه القاضي قائلا: "اسمع المحكمة"، فرد بديع بقوة: "أين العدل.. أرجوكم أن تعدلوا الميزان؟"، فرد القاضي: "احنا هنعدل الميزان إزاى كده".