وضعت الجيوش الميدانية والمناطق العسكرية أحد فروع القوات المسلحة خطة لتأمين عملية الاستفتاء بمحافظات المرحلة الأولى فى عدد كبير من اللجان الفرعية والعامة، بوضع قوات التأمين الثابتة والاحتياطية القريبة والبعيدة ودوريات التأمين المتحركة، وإعطاء التلقين الكامل لجميع عناصر القوات المسلحة المعاونة فى تأمين الاستفتاء وحماية الأهداف والمنشآت الحيوية المهمة بالدولة. حيث اعطت القيادة العامة للقوات المسلحة توجيهاتها بضرورة التعامل مع أى تهديدات تمس أمن المواطنين خلال عملية الاستفتاء، والتأكد من تكثيف إجراءات التأمين على الحدود البرية، والساحلية على كافة الاتجاهات الاستراتيجية ضد أعمال التسلل والتهريب بالتعاون مع قوات حرس الحدود والأفرع الرئيسية للقوات المسلحة.