أشاد الدكتور مصطفى الفقي، مدير مكتبة الإسكندرية، بجهود وزارة الأوقاف وشجاعة وزير الأوقاف الدكتور محمد مختار جمعة، في نشر الفكر الوسطي المستنير ومواجهة الفكر المتطرف وتصحيح المفاهيم الخاطئة. كما أشاد بإصدارات الأوقاف في مجال الترجمة والنشر بصفة عامة، وتجديد الخطاب الديني بصفة خاصة. جاء ذلك خلال كلمته عن بناء الشخصية الوطنية في ملتقى الفكر الإسلامي بساحة مسجد الإمام الحسين (رضي الله عنه)، حيث قال: "لقد نالت وزارة الأوقاف تقدمًا ملحوظًا في ظل وزيرها النشيط جدًا، حيث استطاع أن يمزج بين صحيح الدين والعلوم الأخرى". وأوضح أنه عاصر عشرين ملتقى فكريًا غير أن وزير الأوقاف قد أعطى هذا الملتقى الفكري مذاقًا خاصًا، وجعله متاحًا لجميع الفئات في مخاطبة العقول والقلوب بثقافات وعلوم متنوعة.