أدانت جماعة الإخوان المسلمين إعدام حبارة والذي صدر بحقه أكثر من حكم بالإعدام، وذلك رغم تورط عادل حبارة في العديد من الجرائم الإرهابية حتى في وقت وجود الإخوان في السلطة وبعد خروجهم حيث نفذ مذبحة رفح الثانية بحق الجنود المصريين في 19 أغسطس 2013 . ونعت الجماعة الإرهابية حبارة في بيان رسمي لها معتبرًا أن إعدامه ظالم كما اعتبرت حبارة معارض للنظام السياسي في مصر وليس عضوًا في تنظيم إرهابي. وأضافت جماعة الإخوان فى بيانها، أن قاتل جنود الجيش المصرى فى أحداث رفح المعروفة، ناشط سياسي وأنه ما كان يجب أن يصدر بحقه حكم بالإعدام.