أكد اللواء علاء عز الدين، المدير الأسبق لمركز الدراسات الإستراتيجية للقوات المسلحة، أن مسئولية مكافحة الإرهاب في مصر ملقاة علي عاتق مجلس الدفاع الوطني والذي يختص بالدفاع عن الدولة داخلياً وخارجياً، مؤكداً أن هذا الأمر ليس من اختصاصات مجلس الأمن القومي المصري. وأضاف "عز الدين" في تصريح خاص ل "صدى البلد" أن مجلس الأمن القومي يعني بوضع استراتيجيات عمل للدولة ورؤية استراتيجية عامة فيما يخص قضايا الدولة بشكل عام، مشيراً إلى أن تنفيذ هذة الإستراتيجية ليس من اختصاص مجلس الأمن القومي، علي الرغم من وجود عدد مشترك من المشاركين في المجلسين الأمن القومي والدفاع الوطني. وكانت مصادر قد كشفت عن أن مهمة اللواء جمال الدين مستشار الرئيس لمكافحة الإرهاب الذي أقاله الرئيس الأسبق محمد مرسي، من وزارة الداخلية، تقتطع ملف التعامل مع المخاطر الإرهابية من وزارة الداخلية بدرجة كبيرة ليتم التعامل معه مباشرة من خلال مجلس الأمن القومي الذى يتلقى التقارير في هذا الشأن من "الداخلية والمخابرات والدفاع" وغيرها من المؤسسات ذات الصلة، لكى يقوم بوضع تقدير موقف وتقديمه إلى جهتين، الأولى هي رئاسة الجمهورية، والثانية هي لجنة إدارة الأزمات التي يرأسها محمد العصار عضو المجلس الأعلى للقوات المسلحة.