تعرض " البديل " توصيات المؤتمر العملى الثانى للاعجاز العلمى فى القرأن والسنة والتى قام بعرضها رئيس جامعة بنى سويف د. أمين لطفى وكان فى مقدمتها، تشجيع إعداد البحوث والدراسات للإعجاز العلمي في القرآن الكريم، في مجالات العلوم المختلفة، بكليات الجامعة وتخصيص جوائز سنوية، لأفضل الأبحاث والكتابات. وطالب رئيس الجامعة بضرورة الاستفادة من نتائج الاعجاز العلمي لعرض صورة صحيحة عن الاسلام بأنه دين علم، فضلا عن تفعيل وحدة الاعجاز العلمي بالجامعة ومخاطبة المجلس الأعلى للجامعات لتفعيل آدائها، وتعميمها على مستوى الجامعات المصرية. كما أوصى لطفى بجعل الإعجاز العلمي ضمن المناهج الدراسية في مرحلة البكالوريوس والدراسات العليا، وأن يوجد بالهيئة لجنة يكون لها دور فعال في حسم القضايا الاجتماعية والانسانية التي تمثل حقائق ثابته لا جدال فيها. وتابع: يجب إنشاء مشروع خيري لدعم الاعجاز العلمي، يكون بغرض الاستمرارية، لنشر البحوث المتعلقة بالإعجاز العلمي في القرآن والسنة، كما يجب حصر جميع العلماء وإنجازاتهم وأبحاثهم، على أساس كونه تراثا مهما، نستطيع به خدمة الأجيال الحالية والمقبلة، فضلا عن إصدار مجلة علمية دولية بين الجامعة والهيئة العالمية للإعجاز العلمي وبين اتحاد الجامعات العربية، تكون باللغة العربية.