وجه البابا شنودة الثالث بابا الاسكندرية وبطريرك الكرازة المرقسية شكر وتحية الي فضيلة الامام الاكبر الدكتور أحمد الطيب شيخ الازهر علي بيانه الذي ادان فيه الجريمة الوحشية التي حدثت في كنيسة سيدة النجاة للسريان الكاثوليك في وسط بغداد. وأعرب في محاضرته الاسبوعية عن تقديره لشيخ الازهر لرفضه التهديد الذي تعرضت له الكنيسة القبطية من تنظيم القاعدة في العراق حيث شدد الامام الاكبر علي حرمة الاعتداء علي دور العبادة لغير المسلمين مؤكدا ان الاسلام يحمي غير المسلمين ويكفل لهم الحماية وممارسة الشعائر . وأكد البابا شنودة أن الإسلام يُحرم مثل هذه الاعتداءات ويرفضها جملة وتفصيلاً، وأنه لايقبل أي تهديد لكنائس وأديرة مصر. وقال البابا ان بعض الازمات يكون له وجه ايجابي وكان من نتائج هذا التهديد ما تلقيناه من تضامن الكثير من المؤسسات الاسلامية ومن الكثير من الكتابات الصحفية التي عبرت عن مساندتها للكنيسة . كما وجه البابا شنودة تحية تقدير الي وزارة الداخلية التي قامت بتوفير بوابات الكترونية لتفتيش المترددين علي الكاتدرائية والكشف عن المفرقعات . من ناحية اخري قرر البابا شنودة منع الاساقفة من التحدث الي الاعلام بدون اذن مسبق منعا لحدوث اي ازمات مستقبلية لاطائل من ورائها.