اقيمت صلاة اليوم الثالث علي أرواح الشهداء بثلاث كنائس وترأس قداسات الصلاة عدد من الاساقفه وهم الأنبا اثناسيوس أسقف بني مزار والأنبا أغاثون اسقف مغاغة والعدوة. والأنبا مكاريوس أسقف المنيا وأبوقرقاص والأنبا اسطفانوس اسقف ببا والفشن وحضر ممثل عن البابا تواضروس هو الأنبا يوأنس أسقف أسيوط بكنيسة السيدة العذراء الأثرية بدير الجرنوس مسقط رأس اكبر عدد من الشهداء وعددهم 10. قال القس غبريال محب بمطرانية المنيا إن "صلاة الثالث" هي صلاة تقام في اليوم الثالث للوفاة عند موت أي قبطي أرثوذكسي للترحيم من المعتاد أن تقام بمنزل المتوفي وتؤدي بهدف صرف روح الحزن من المنزل لتعزية الأسرة إلا أن الكنيسة رأت أن يتم اقامة الصلاة بشكل جماعي بمقر الكنائس بمسقط رءوسهم يرجع إلي كثرة عدد الشهداء.