في الذكرى الرابعة عشر لأحداث 11 سبتمبر التي ضربت الولاياتالمتحدة عام 2001، شكك الرئيس الأفغاني السابق حامد كرزاي في مسؤولية تنظيم القاعدة وزعيمه الراحل أسامه بن لادن عن الهجمات. ونقلت صحيفة الجارديان البريطانية عن كرزاي وصفه لتنظيم القاعدة ب" الخرافة"، نافيا أن يكون التخطيط للهجمات التي أسفرت عن مقتل آلاف الأمريكيين حدث في أفغانستان. واضاف كرزاي أن التخطيط ل 11 سبتمبر لم يتم في الدولة الأسيوية". وردا على سؤال إذا ما كانت تنظيم القاعدة في أفغانستان وراء الهجمات التي أسقطت برجي التجارة العالمي، واستهدفت مواقع أمريكية مختلفة أجاب قائلا: “ أستطيع إخبارك حقيقة أن العملية لم يخطط لها من أفغانستان". يذكر أن بن لادن ادعى المسؤولية عن الهجمات في العديد من المناسبات، كما أن مقاطع فيديو للمشاركين في الهجمات سجلت في قندهار حيث تدربوا في معسكرات تابعة للقاعدة. ووصل بن لادن أفغانستان عام 1996، هاربا من السودان التي عاش فيها منذ 1991 .واستقر في بداية الأمر في مناطق جبلية بمدينة جلال آباد الباكستانية قبل الانتقال جنوبا إلى قندهار التي تمثل المقر الإداري والروحي لطالبان. واغتالت قوات كوماندوز أمريكية بن لادن عام 2011 في 2 مايو 2011 خلال هجوم على منزل بمدينة آبوت أباد الباكستانية التي انتقل إليها زعيم تنظيم القاعدة الراحل في وقت لاحق.