قرر مجلس جامعة سوهاج برئاسة الدكتور نبيل نور الدين رئيس الجامعة، إلغاء البروتوكول الموقع بين جامعتي سوهاج ورجب طيب أردوغان بتركيا، وذلك نظراً للموقف السياسي المُعادي تجاه مصر. وأشار رئيس الجامعة إلى أن قرار إلغاء هذا البروتوكول جاء بعد مناقشته في مجلس الجامعة، والذي وافق بالإجماع على هذا القرار مساندة للسياسة الخارجية لمصر، وتعبيراً من الجامعة على الاهتمام بالمصلحة العامة للوطن. يذكر أن البروتوكول الموقع بين الجامعتين فى عهد المحافظ السابق الدكتور يحيى مخيمر، والذي يمتد إلى عام 2018، يحتوي على التبادل بين الأساتذة وطلبة الجامعة في الكثير من التخصصات، منها "كليات الاقتصاد والتربية والهندسة والطب، إضافة للتمريض والسياحة والزراعة".