قال د.عبد المنعم أبو الفتوح أنه ينتمي لجماعة الإخوان المسلمين ويفتخر بكونه كان منهم ونفى استقالته من الجماعة وقال : هذا عبث إعلامي وتحريض أمني ، وأكد أن موضوع الاستقالة كان مرتبطا بنية الترشح لرئاسة الجمهورية مؤكداً أنه قال لو نويت خوض انتخابات الرئاسة سأكون مرشحا مستقلا بدون أن أحمل جماعة الإخوان عبء قراري ، ولكني حتى الآن لم أقرر نية الترشح وبالتالي لم أستقل من الجماعة ، وما حدث هو فتنة أمنية قامت بها مجموعة من الأمن السابق الذي مازال موجودا ويفسد في مصر ويعمل ضد الثورة وما نشر أكاذيب عارية من الصحة . وتابع أبو الفتوح في حوار له على قناة المحور: يشرفني أن أكون منتميا للإخوان وهم أصحاب فضل علي وأنا منهم وأمين على هذه المدرسة ويشرفني أن أكون منهم ورئيس هذه المدرسة هو الشيخ العظيم يوسف القرضاوي . واستطرد أبو الفتوح : سأستقيل من الإخوان إداريا إذا قررت الترشح لرئاسة الجمهورية ووقتها سأعلن ذلك بنفسي للإعلام ، وأكد أبو الفتوح أنه يفكر في الترشح للرئاسة من أجل خدمة مصر ولكنه لم يقرر بعد ويدعو الله أن يكون عنده القدرة على ذلك . واستنكر أبو الفتوح أن يكون الإخوان فزاعة للناس وقال:الإخوان مش عو" ولا يرهبون أحد بالعكس الإخوان هم الإسلام المعتدل ، والحزب الوطني هو الذي كان يجعل من الإخوان فزاعة في الداخل الخارج وعلى الناس أن ينظروا لأفعالنا ويقرروا من نحن وعلى الحزب الوطني أن يقدم نفسه أيضاً وعليه أن يرى شعبيته الحقيقية بين الناس لأنه طالما زور الانتخابات. ونفى أبو الفتوح أن الإخوان يسعون للسلطة وقال : الناس خائفة من أن يحكم الإخوان والإخوان أعلنوا أنهم لن يحكموا وأريد أن أطمئن الناس أن الإسلام لا يعرف الدولة الدينية فلماذا نخاف من الإخوان فلن يحولوا مصر لدولة دينية لأنه على مدار تاريخ الإسلام 15 قرن لم تحكم دينياً فليس هناك محل لإثارة قصة دولة دينية إلا لمن أراد أن يمحي الدين ويرهب الناس من الإسلام وهذا لن يحدث. وتابع أبو الفتوح : الناس متوهمة أن الإخوان لو حكموا سيقيمون الحدود وسيظهرون على الناس بالعمة والجلبية ، وهذا لن يحدث فنحن مثل أي فصيل لو وصلنا للحكم ستكون مصر دولة مدنية وفيها برلمان وفيها حرية وديمقراطية واحترام حقوق الإنسان ليس هناك تغير كما هو الآن ولكن الممارسة ستكون صادقة. وقال أبو الفتوح أن الإخوان لا يتحدثون باسم الإسلام بل يقدمون فهمهم للإسلام وعلى الناس أن تقنع بهم أو لا وليس هناك أحد يتحدث باسم الإسلام ولا يحتكره لنفسه . وأكد د. أبو الفتوح أن مصر بها برلمان سواء جاء الإخوان في الحكم أم لا وأي شيء مختلف عليه سيناقش في البرلمان مثل تداول الخمر أو وجوده للسياحة فالأمر ليس فيه إلزام من الإخوان كل شيء يطرح ويناقش في البرلمان.