رد جهاز الكسب غير المشروع على ما أثير من شبهات حول المهندس عاطف عبدالحميد، محافظ القاهرة الجديد، مشيرًا إلى أن الجهاز بالفعل حقق معه، بالإضافة إلى قيادات بوزارة الطيران فى بلاغات مقدمة ضدهم لتورطهم فى قضايا فساد. وأوضح الجهاز، فى بيان له، أن التحقيقات انتهت إلى حفظ الأوراق بالنسبة لجميع المشكو في حقهم في عام 2013، مؤكدًا أن المهندس عاطف عبدالحميد، لم يقم بسداد أية مبالغ مالية لأي جهة. وكان عدد من نواب البرلمان تقدموا بطلبات إحاطة للدكتور أحمد زكي بدر، وزير التنمية المحلية، للاستفسار عن كيفية تعيين المهندس عاطف عبدالحميد وزير النقل الأسبق، المتهم بالفساد والاستيلاء على 4 ملايين جنيه من أموال وزارة الطيران المدني، محافظًا للقاهرة. وخضع وزير النقل الأسبق، لتحقيقات جهاز الكسب غير المشروع، في عام 2013 عقب اتهامه بالفساد هو وعبدالعزيز فاضل، نائب رئيس شركة مصر للطيران والصيانة والأعمال الفنية، وعقب ذلك قرر المستشار مصطفى أبو زيد رئيس هيئة الفحص والتحقيق بجهاز الكسب، بصرفهما.