زعمت مصادر من حركة "حماس"، أن توقيع صفقة شاليط تم بعد أن حصلت إسرائيل على وثيقة مكتوبة تفيد بموافقة الحركة على عدم إرفاق أسماء الأسرى الخمسة الكبار فى قائمة الأسرى الذين سيتم الإفراج عنهم خلال الصفقة. ووفقاً للتقارير التى نشرتها صحيفة "معاريف" الإسرائيلية، فقد تم الاتفاق على عدم الإفراج عن إبراهيم حامد، عبد الله البرغوثى، عباس السيد، مروان البرغوثى، أحمد سعدات، حيث فضل هؤلاء الأسرى أن يتنازلوا عن حقهم فى الخروج من السجون الإسرائيلية حتى تتم الصفقة، ويتم الإفراج عن الأسرى الفلسطينيين الآخرين الموجودين بالسجون الإسرائيلية. وأشارت الصحيفة إلى أن الأسرى الأردنيين الموجودين فى السجون الإسرائيلية لن يتم الإفراج عنهم خلال صفقة شاليط، ولكن سيفرج عنهم فى إطار صفقة إيلان جرابيل - ضابط الموساد المتهم بالتجسس لصالح إسرائيل - والموجود حاليًا فى السجون المصرية، مشيرة إلى أنه سيتم تبديل جرابيل ب81 أسيرًا مصريًا وأردنيًا.