يدرس قطاع النقل البحري حاليا تخفيض الرسوم التي تحصلها هيئة ميناء الاسكندرية من السفن السياحية التي تم رفعها بقرار من وزير النقل أوائل العام الحالي. أشار اللواء توفيق أبو جندية رئيس قطاع النقل البحري في المنتدي البحري الذي اقامته شركة توتال لوجيستيكا إلي أن الرسوم مرتفعة بصورة ملحوظة وأنه يتم اعداد مذكرة لوزير النقل لتخفيضها حتي تصبح الرسوم في ميناء الاسكندرية منافسة للموانئ الأجنبية. وتقوم هيئة ميناء الاسكندرية حاليا بتحصيل الرسوم المضاعفة بعد صدور قرار مفاجئ بإلغاء معاملة السفن الأجنبية كالمصرية في ميناء الاسكندرية من حيث التعاملات المالية مما تسبب في أزمة بين هيئة الميناء والشركات السياحة والملاحية. ووصف رجال الأعمال وقتها القرار بالصادم خاصة الشركات التي تحرص علي تعامل سفنها السياحية مع ميناء الإسكندرية لأن ذلك سيقضي علي السياحة في ميناء الإسكندرية. ومنذ أوائل العام أرسل رجال الأعمال مذكرات لكل الجهات سواء وزيري النقل والسياحة وهيئة ميناء الاسكندرية لكن لم يتحرك أحد. كانت هيئة ميناء الاسكندرية وقطاع النقل البحري بالاسكندرية قد قررا فجأة اعداد مذكرة لوزير النقل لاصدار قرار بإلغاء حصول السفن السياحية الأجنبية علي نفس معاملة السفن المصرية من الناحية المالية وبالفعل صدر القرار رقم 623 لسنة 2008 في 30/11/2008 بالغاء أي امتيازات كانت تحصل عليها السفن السياحية التي تتعامل مع ميناء الاسكندرية وأن تعامل السفن السياحية وسفن الركاب الأجنبية المترددة علي ميناء الاسكندرية بالنقد الأجنبي.