أكدت الأمانة العامة لمجمع البحوث الإسلامية أنه لا يوجد حاليًا جمعية أهلية باسم "جبهة علماء الأزهر" قائلة" والذين يدّعون وجود جمعية بهذا الاسم لا يمثلون إلا أنفسهم" . وأوضح مجمع البحوث في بيان له الاثنين 22 يوليو، أن الأزهر الشريف – كأكبر مؤسسة دينية إسلامية في العالم- يمثله هو فضيلة الإمام الأكبر شيخ الأزهر، والهيئات التي يشملها الأزهر الشريف وعلي رأسها هيئة كبار العلماء. وقال البيان " لقد تأسست جبهة علماء الأزهر عام 1946م كجمعية أهلية، وتم إشهارها لدى وزارة الشئون الاجتماعية، وقد نصَّ نظامها الأساسي على أن المقصد العام لهذه الجمعية هو إعزاز الإسلام والمسلمين، ورفع شأن الأزهر والأزهريين. وتابع"وقد ظلت هذه الجبهة تؤدي عملها – كجمعية أهلية – على النحو الصحيح، حتى انحرفت عن الجادة، وخرجت عن أغراضها، وبدلًا من أن تعمل على رفع شأن الأزهر والأزهريين أخذت تنال من الرموز الدينية لهذا المجتمع وكبار علمائه، وغير ذلك من المخالفات ، وبناءً على ذلك تمَّ حلّ مجلس إدارة هذه الجمعية وتعيين مجلس مؤقت لها بقرار محافظ القاهرة رقم (381) لسنة 1998م ، وقد صدر حكم المحكمة الإدارية العليا بصحة قرار السيد محافظ القاهرة المشار إليه، وهو حكم بات لا يقبل الطعن عليه بأي حال، ثم تمَّ تغيير اسم هذه الجمعية من "جبهة علماء الأزهر" إلى "الجمعية الخيرية للعاملين في هيئات الأزهر" بتاريخ 8/4/1998م" .