الكأس ستذهب إلي إسم لم يحقق اللقب من قبل وهي سمة بارزة من سمات الالفية الثالثة سواء كان حلمي طولان في الزمالك أو هاني رمزي في دجلة. حيث شهدت الالفية الثالثة كتابة مديرين فنيين اسمائهم باحرف من الذهب بسبب احراز اللقب لأول مرة في تاريخهم وهم حسن شحاتة و مختار مختار وطه بصري وفتحي مبروك ومحسن صالح وطارق العشري ويعد مانويل جوزيه المدير الفني الأسبق للاهلي وطارق العشري المدير الفني الأسبق للحدود, هما أكثر المديرين الفنين حصولا علي اللقب المحلي في الألفية بعد أن نالا الكأس مرتين من قبل. كما كتبت البطولة في الألفية الثالثة ظهور بطلين جديدين في عالم منصات التتويج هما انبي الذي توج بطلا مرتين لها, وحرس الحدود الذي يملك الرصيد نفسه كأس مصر في الألفية الثالثة هي بطولة المفاجأت, فخلال النسخ التي أقيمت منذ عام2000 حتي الآن لم يحقق القطبان الاهلي والزمالك معا لقب البطولة سوي6 مرات فقط فيما ذهب اللقب لأندية اخري في6 مناسبات أخري. والبداية كانت صيف عام2000 عندما توج الاسماعيلي تحت قيادة محسن صالح المدير الفني بطلا للبطولة في نهائي لأبناء العمومة جمعه مع المقاولون العرب وانتهي بفوز كبير للدراويش بأربعة اهداف مقابل لاشيء كان نجمها الاول محمد صلاح أبوجريشة بتسجيله هدفين في شباك ذئاب الجبل وفي الموسم التالي2001/2000 عاد الكأس مرة اخري الي عالم القطبين عبر بوابة الاهلي هذة المرة تحت قيادة مديره الفني الالماني هانز ديكسي بالفوز علي غزل المحلة بهدفين مقابل لاشيء في المباراة النهائية بينهما ووقتها سجل علاء ابراهيم و ثنائية الاهلي في شباك الفلاحين. وفي موسم2002/2001, كان الموعد مع تتويج زملكاوي هذة المرة, بعد خسارة الفريق الأبيض لبطولة الدوري الممتاز, ووقتها ألتقي الزمالك تحت قيادة الألماني أوتوفيستر مع بلدية المحلة تحت قيادة عبدالعزيز عبدالشافي زيزو في المباراة النهائية للبطولة, ونجح الزمالك في حسم اللقب لصالحه بعد الفوز بهدف مقابل لاشيء سجله مهاجمه وقتها عبدالحليم علي وكانت هي اخر بطولات الالماني اوتوفيستر الذي رحل بعد التتويج بسبب هزيمته التاريخية امام الاهلي لكن في الدوري بستة أهداف مقابل هدف وفي الموسم التالي2003/2002 عاد الأهلي الي منصات التتويج من جديد وعبر مديره الفني المؤقت فتحي مبروك عندما توج بطلا علي حساب الاسماعيلي بنتيجة4/5 بركلات الترجيح بعد تعادلهما بهدف لكل فريق. وفي موسم2004/2003 بدأ الانقلاب الكبير عندما فقد الاهلي ومديره الفني مانويل جوزيه لقب البطولة عقب الخسارة امام المقاولون العرب بهدفين مقابل هدف وكان هذا اللقب هو بداية بزوغ نجم حسن شحاته المدير الفني لذئاب الجبل حيث فتحت امامه ابواب الانتقال للعمل مديرا فنيا للمنتخب الوطني ووقتها ارتكب مانويل جوزيه خطأ قاتل عندما استبدل3 لاعبين دفعة واحدة وتعرض بعدها حارسه امير عبدالحميد للاصابة ليضطر لاستكمال اللقاء بشادي محمد مدافع الفريق في مركز حراسة المرمي وسجل ثنائية المقاولون العرب روبرت اكوروي ومحمد فهيم فيما سجل محمد جودة هدف الاهلي الوحيد في اللقاء وفي موسم2005/2004 كان الموعد مع حدث تاريخي حيث كتبت البطولة مولد بطل جديد لم يسبق له تحقيق أية ألقاب من قبل, وهو فريق الكرة الأول بنادي انبي الذي حقق لقب البطولة بعد تغلبه علي الاتحاد السكندري بهدف مقابل لاشيء سجله مجدي عبدالعاطي, ليحقق انبي لقبا تاريخيا تحت قيادة مدربه الناجح وصاحب البداية القوية له طه بصري. فيما شهدت النسخة سيطرة الاهلي والزمالك علي المباراة النهائية لموسمين متتاليين ولكن مع تتويج أحمر في ظل وجود جيل ذهبي وقتها برفقة مانويل جوزية وعدم استقرار اداري في الزمالك ففي موسم2006/2005 نجح الاهلي في احراز لقب البطولة علي حساب الزمالك وهزمه بثلاثة أهداف مقابل لاشيء في المباراة النهائية. وفي الموسم التالي2007/2006 حقق الاهلي اللقب للمرة الثانية علي التوالي ولكن بعد نهائي مثير تبادل خلاله مانويل جوزية مدرب الاحمر وهنري ميشيل مدرب الاهلي التألق وحقق الاهلي اللقب بعد الفوز باربعة اهداف مقابل ثلاثة وعبر وقت اضافي وسجل رباعية الاهلي كل من اسامة حسني هدفين وعماد متعب ومحمد أبوتريكة للاهلي وجمال حمزة وعمرو زكي وشيكابالا للزمالك وبعد7 سنوات من الغياب وتحديدا في موسم2008/2007 عاد الزمالك مرة اخري الي منصة التتويج عبر تتويجه بطلا لمسابقة كأس مصر هذه المرة تحت قيادة الهولندي رود كرول وهو اخر لقب حققه الزمالك في عالم كرة القدم, وتغلب وقتها علي انبي بهدفين مقابل هدف في المباراة النهائية, وتقدم اسامة حسن بهدف أول للزمالك ثم رد محمد يونس مدافع انبي بالتعادل لصالح فريقه قبل ان ينجح عمرو زكي في خطف هدف التتويج والفوز للزمالك في الدقيقة81 وقبل نهاية اللقاء ب9 دقائق فقط. وفي موسم2009/2008 كتب التاريخ بطلا نال اللقب لأول مرة في تاريخه وكان حرس الحدود تحت قيادة طارق العشري بعد فوزه علي انبي1/4 بركلات الترجيح في المباراة النهائية بينهما وتقدم الحدود بهدف في اللقاء لمهاجمه أحمد حسن مكي وتعادل احمد عبدالرؤوف لانبي ليحتكما الي ركلات الترجيح والطريف ان كلا المهاجمين الان محترف في الدوري الليبي ضمن القطبين اهلي واتحاد طرابلس علي الترتيب. وفي موسم2010/2009 حافظ حرس الحدود مع مديره الفني طارق العشري علي لقب بطل الكأس بعد الفوز علي الاهلي بنتيجة4/5 بركلات الترجيح عقب تعادلهما بهدف لكل فريق, حيث تقدم احمد سالم صافي للحرس وتعادل محمد بركات للاهلي ليحتكما الي ركلات الترجيح التي كتب فيها الحدود نفس سيناريو2009 بتتويجه علي حساب انبي وقتها. وفي موسم2011/2010 خالفت كرة القدم كل التوقعات عندما فقد الزمالك تحت قيادة مديره الفني الكبير حسن شحاتة فرصة حمل اللقب والاحتفال به, رغم عروضه القوية قبلها وانتصاراته الكبيرة علي العديد من الفرق عقب خسارته امام انبي الذي كان يدربه وقتها مختار مختار المدير الفني بهدفين مقابل هدف في المباراة النهائية, واستحق انبي التتويج بعد أن حسم اللقب علي حساب القطبين سواء الاهلي عندما اطاح به من دور الستة عشر أو الزمالك في النهائي. وكان الزمالك تقدم بهدف لعمرو زكي ثم تعادل عادل مصطفي لإنبي قبل ان يخطف أحمد عبدالظاهر مهاجم الاهلي حاليا هدف الفوز لفريقه البترولي في الدقيقة81 وقبل النهاية ب9 دقائق فقط ليكتب التاريخ من جديد وينال اللقب ولم تقام البطولة في موسم2012/2011 حيث ألغيت بطولتي الدوري الممتاز وكأس مصر بسبب احداث مذبحة بورسعيد.