اعتمد مجلس إدارة الاتحاد المصري لكرة القدم شكل مسابقات موسم 2020-2021، في ضوء دراسة سلبيات وإيجابيات مسابقات القسم الثاني والثالث والرابع للموسم الرياضي 2019-2020. والتي جاءت على النحو التالي: أولاً: القسم الثاني يتكون من ثلاث مجموعات كل منها تتكون من (16) فريقا بإجمالي 48 فريقا (ال 36 فريقا + 12 فريقا الحاصلين على المركز الأول في المجموعات ال 12 بالقسم الثالث)، ويقام بين كل مجموعة من المجموعات الثلاث دوري من دورين يصعد أول كل مجموعة إلى القسم الأول. وينتهي قيد اللاعبين في 21/11/2020 م، فيما تبدأ المباريات يوم 25/11/2020. ثانياً: القسم الثالث يتكون من 178 فريقا (155 فريقا + 23 فريقا متأهلا من القسم الرابع)، يتم تقسيمها إلى 12 مجموعة، يصعد أول كل منها إلى القسم الثاني. وينتهي القيد في 28/11/2020، على أن تبدأ المباريات في 30/11/2020. ثالثاً: القسم الرابع يتكون من 352 ناديا + الأندية المنضمة حديثاً توزع على المجموعات حسب الموقع الجغرافي، وينتهي القيد في 30/11/2020 م ، لتبدأ المباريات في الأسبوع الأول من شهر ديسمبر 2020. رابعاً: تخصيص مجموعة لسيناء تشجيعاً لمشاركة الأندية في جنوب وشمال سيناء وتوسيع قاعدة الممارسة تماشياً مع سياسة الاتحاد وأهدافه سوف يتم تخصيص مجموعة بالقسم الثالث اعتباراً من موسم 21/22 يصعد الأول منها مباشرة إلى القسم الثاني. ومن المقرر أن يعقد الاتحاد مؤتمرًا صحفيًا في موعد يتحدد لاحقا لعرض شروط ونظام المسابقة وذلك فور انتهاء تصفيات القسم الرابع.