طالبت المنظمة العربية للإصلاح الجنائى بتشكيل لجنة مستقلة لحصر جرائم النظام السابق بأكمله، مشيرة إلى عشرات الجرائم التى ارتكبها الرئيس السابق ونظام حكمه بخلاف القضايا التى يحاكم عليها حاليا. رصدت المنظمة العديد من القضايا التى يجب أن يحاكم مبارك عليها منها قضايا التعذيب، وتزوير الانتخابات، والاختفاء القسرى، والقتل خارج القانون، ومحاكمة المدنيين أمام القضاء العسكرى، وسوء الأوضاع الصحية، وبيع شركات القطاع العام بأقل من قيمتها السوقية مما ترتب عنها إهدار ثروات البلاد. وطالبت المنظمة بمعاقبة كل مسئول تسبب فى إدخال مواد مسرطنة للبلاد، مما أدى إلى تفشى العديد من الأمراض والأوبئة فى مصر، وشددت المنظمة علي ضرورة تشكيل لجنة قضائية لبحث غياب أدلة الثبوت فى قضية قتل المتظاهرين فى ثورة 25 يناير والطمس العمدى لها، وذلك خلال ورشة عمل حول "أوضاع المحاكمات فى ظل الثورات العربية" التى عقدتها اليوم السبت، بالتعاون مع الشبكة العربية للتسامح برئاسة الدكتور إياد البرغوثى. كما أوصى العديد من المحامين المدعين بالحق المدنى لصالح شهداء ومصابى ثورة 25 يناير، خلال ورشة العمل، بإلغاء المحاكمات العسكرية واستبدالها بالمحاكم المدنية، وإلغاء المناصب بالتعيين من قبل رئيس الجمهورية، منها منصب النائب العام.