اصدر الرئيس عبدالفتاح السيسى قرارا جمهوريا بشأن تنظيم الأمانة العامة لمجلس الأمن القومى ينص على تشكيل الأمانة العامة للمجلس برئاسة الأمين العام وعدد كاف من الأعضاء ويكون مقرها مدينة القاهرة. وصرح السفير إيهاب بدوى المُتحدث الرسمى باِسم الرئاسة بان القرار حدد اختصاصات الامانة العامة واليات عملها. كما نص القرار على أنه يصدر بتعيين الأمين العام للمجلس وتحديد معاملته المالية قرار من رئيس الجمهورية، فيما نصت المادة الرابعة على أن تعيين أعضاء الأمانة العامة وتحديد معاملتهم المالية يصدر به قرار من الرئيس بناء على ترشيح الأمين العام على ألا تقل درجة أى منهم عن الدرجة الممتازة أو ما يعادلها، وأن يكون من بينهم ممثلون عن وزارات الدفاع، الداخلية، الخارجية، المخابرات العامة. ومن ناحية اخرى أصدر الرئيس قرارا جمهوريا بزيادة المعاشات العسكرية بنسبة 10%، اعتبارا من 1 يوليو الحالي، وذلك دون حد أدنى أو أقصي. ويقصد بالمعاش الذى تحتسب على أساسه الزيادة مجموع المعاشين الأصلى والإضافى المستحقين لصاحب المعاش أو للمستحقين عنه، وما أضيف إليهما من زيادات حتى 30 يونيو 2014.